Генофонд (от ген и лат. fundus - основание), совокупность генов особей, составляющих данную популяцию, группу популяций или вид. Принято считать также, что существует генофонд Земли (биосферы), как совокупность всех видов живых организмов с их проявившимися и вероятными потомственными показателями. Единство генофонда популяции обеспечивается половым процессом (постоянным обменом потомственным материалом внутри популяции). При отсутствии возмущающих влияний на популяцию неограниченной численности специфические для нее частоты генотипов и генов остаются постоянными в безраздельно долгом ряду поколений (правило Хардиайнберга). Частоты генов (аллелей, генотипов) в генофонде популяции меняются под действием генетических факторов: мутационного процесса, миграций, случайных процессов и естественного отбора. Важнейшая особенность генетической структуры популяции - её дифференцированность, пространственная разнородность в пределах ареала вида. Признаки генетического многообразия имеют количественный характер. Для описания генофонда популяции применяют следующие признаки: процент полиморфных локусов (генный полиморфизм), среднее и эффективное число аллелей, приходящихся на локус, наблюдаемая и ожидаемая гетерозиготность, уровень внутривидовой (Н3), Внутрипопуляционной (Hs) И Межпопуляционной (Fg-f или GST) изменчивости, степень инбридинга (Fjg), параметры системы скрещивания (частота само- и перекрестного опыления), микродифференциация. Для оценки генетического многообразия применяют разнообразные классы молекулярно-генетических маркеров и способ электрофореза ферментных и др. белков.